Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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RPE65Q16518 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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