Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F4Q16254 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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