Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.9 ms