Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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