Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
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