Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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