Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
COL19A1Q14993 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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