Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms