Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PICALMQ13492 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PICALMQ13492 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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