Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
FOXE3Q13461 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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