Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PMS2P3Q13401 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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