Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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SKP2Q13309 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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SKP2Q13309 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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SKP2Q13309 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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SKP2Q13309 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
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SKP2Q13309 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
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SKP2Q13309 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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