Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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GPS1Q13098 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GPS1Q13098 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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