Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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