Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTP4A2Q12974 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PTP4A2Q12974 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PTP4A2Q12974 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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PTP4A2Q12974 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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