Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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