Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ERFP50548 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERFP50548 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ERFP50548 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERFP50548 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERFP50548 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms