Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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