Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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