Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPL17P18621 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPL17P18621 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPL17P18621 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPL17P18621 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPL17P18621 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms