Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms