Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
J3QKU1 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
J3QKU1 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms