Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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