Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
DLL3Q9NYJ7 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DLL3Q9NYJ7 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms