Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms