Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms