Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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