Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
UBR3Q6ZT12 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
UBR3Q6ZT12 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms