Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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CCDC96Q2M329 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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CCDC96Q2M329 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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CCDC96Q2M329 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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CCDC96Q2M329 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC96Q2M329 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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CCDC96Q2M329 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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CCDC96Q2M329 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC96Q2M329 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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