Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GEN1Q17RS7 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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