Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USF2Q15853 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USF2Q15853 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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USF2Q15853 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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USF2Q15853 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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USF2Q15853 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
USF2Q15853 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USF2Q15853 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USF2Q15853 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USF2Q15853 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USF2Q15853 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
USF2Q15853 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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