Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms