Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBE3CQ15386 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBE3CQ15386 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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