Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NKX1-1Q15270 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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