Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPHQ15003 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NCAPHQ15003 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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