Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMCO1Q147U7 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
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