Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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