Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UBE4AQ14139 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms