Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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