Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
IRF5Q13568 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IRF5Q13568 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.9 ms