Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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