Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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