Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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