Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPA4Q13156 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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