Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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