Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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IFT88Q13099 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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IFT88Q13099 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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IFT88Q13099 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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IFT88Q13099 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IFT88Q13099 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
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IFT88Q13099 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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