Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRDNQ13061 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170 ms