Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HSPB3Q12988 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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