Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.71□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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HOXC5Q00444 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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HOXC5Q00444 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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HOXC5Q00444 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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HOXC5Q00444 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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HOXC5Q00444 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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HOXC5Q00444 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXC5Q00444 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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