Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD12P35452 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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